本作游戏特有的系统包括终符系统：在敌人方面，终符是一个额外的加分关卡，在这个关卡中不必担心损命和失去炸弹；在玩家方面，终符是一种更高级的“炸弹”符卡，只有在被子弹击中时按出的决死炸弹才会发动，它以两枚炸弹为代价，换取一个持续时间更长、威力更强的炸弹效果。新系统还包括一个显示人类指数/妖怪指数的状态槽，以及新的“倍率”系统，这些都会对游戏产生影响。

自机

游戏开始时从不同性能的角色组中选择其中一组作为自机。

移动

移动分为高速移动及低速移动两种，可透过按钮（默认为键盘Shift键）改变移动方式。高速移动是通常的移动方法，低速移动则会把自机的移动速度降低以加强操作精细度，用以在密集的弹幕间回避。

射击

射击的性能根据角色及武器种类而有所差别。高速移动或低速移动也会令射击变化，高速时为重视“范围”而“威力”较低，低速度为重视“威力”而“范围”较窄。

Power up、道具自动收集

从击破的敌人中取得的P道具可增加自机的“Power”以强化自机射击的威力。当“Power”达到128时即会进入“Full Power Mode”。Full Power Mode时当自机移动到画面上方的时候道具将自动被自机回收，这被称为“道具自动收集”。

Bomb

使用时会把画面上的弹幕变为☆道具，并有短暂无敌时间的特殊攻击。BOMB是“自机符卡”，有使用次数限制。

Extend

取得一定点道具后可获得1UP。

Miss后复归、续关

自机被弹幕击中即为Miss，Power减少，当时在画面上的弹幕会被消去，残机数减少1只，并且自机会由画面底方回到画面中。残机0时Miss的话，则会进入选择是否续关的画面。续关后在当地重生，并有续关次数限制。若续关的话结局将变成“Bad Ending”，当不能再续关的时候就会结束游戏。

敌机或自机被击破时会掉落道具。

P道具

取得后可增加Power值，增加到一定程度后可加强自机射击。P道具分成小型的和大型的两种，小型的可增加Power值1点，大型的可增加8点。

点道具

取得后可增加分数，取得的位置越高获得分数越高。取得一定数量后获得1UP奖励。

B道具

取得后可增加一次Bomb使用次数。

1UP道具

取得后可直接产生1UP。击退3面、5面或Extra的中头目皆可获得此道具。

F道具

取得后可使Power直接升至全满。在自机残机0之下Miss时会出现。

击中判定及被弹

敌弹或敌机本体接触自机的话会出现声效，同时系统判定自机“被弹”。被弹后，若不能使出后述的“被弹Bomb”，将会被系统判定为“Miss”，同时失去一个残机。自机的击中判定都比眼见为小，而敌方弹幕的有效范围通常也是比眼见更小。

擦弹判定

除击中判定外，自机周围还有一个“擦弹判定”。若敌方弹幕的有效范围在擦弹判定之内，将使“Graze”的点数增加，同时可增加得分。

敌方位置提示

头目战时画面底方会出现一个提示头目位置的标志，随着头目的移动一起移到其正下方。这使得玩家专心回避弹幕的时候也能知道敌方的位置。

命点

低速移动时，自机中间会显示出一个白点。无论显示与否，敌方弹幕击中那个点的位置才判定为被弹。这系统方便玩家进行擦弹得分。实际上，自机真正的击中判定比这个点还要小一些。

本作有“时刻”的概念存在着。大致上是由停止夜晚以解决异变的设定而生的。在故事模式开始时，时刻会从11:00 p.m.开始，若未能在5:00a.m.“拂晓”（夜明け）前完成打败最终头目，将会进入Bad Ending。

刻符、评级

刻符是本作其中的一个固有道具，取得时可使下次取得点道具时的得分较高，并在通过一关后，依照取得的刻符而给予额外得分。当Miss的时候会失去一定数量的刻符。

出现刻符的情况分别有

各关会都有“刻符定额”（刻符ノルマ）的设定存在，若能使这值达至指定值，将在通关时取得甲评级，反则不能达成的话就变成乙评级。此外虽然在游戏说明中表明有丙评级，但制品版似乎不存在这设定。

时刻前进的条件

时刻会分以下条件而有所前进。此外，因为“时间不能倒转”的关系，时刻是不能后退的。

以评级甲通过一关：30分钟

以评级乙通过一关：60分钟

以评级丙通过一关：90分钟

续关：30分钟

“评级甲”通关时只会前进30分钟是由“收集大量刻符以致时间的前进有所改变”的设定而来的。

人类与妖怪的组合

本作的最大特征可以说是人类与妖怪会共同组队作战。透过按键操作，可在游戏中自由交替切换双方来使用。

人间操术与妖怪操术

在高速移动时会操控人类一侧，而在低速移动时则会操控妖怪一侧。由于操作的角色不同，所以本作中高速与低速移动的分别比前两作显得更加大。高速移动的称为“人间操术”，而低速移动的则称为“妖怪操术”。此外，当人间操术时，会常驻角色的“特技”效果；而妖怪操术时，则会出现“使魔”协助作战。此外，妖怪操术时即使Power值未全满也能作道具自动搜集。

妖率计

本作中，画面左下角会有“妖率计”（妖率ゲージ），代表组队的主要程度是偏向妖怪还是人类。值的范围在±100%之间，+时代表偏向妖怪侧，-则是偏向人类侧。

妖率会表以下条件而有所变化

逢魔之时

妖率计达至+80%以上（-80%以下）时，即会进入“逢魔之时”（逢魔が时）状态，并会带来以下各种变化。

虽然自机的操作是由人类与妖怪组成，但只要达成一定条件，就可单独选择各队伍中其中一方进行游戏。这个情况之下，不论高速移动还是低速移动，操作的 角色都固定为所选择的角色。除了蕾米莉亚·斯卡蕾特（慢速固定使魔位置）和魂魄妖梦（慢速固定半灵射击方向）外，射击也不会因高速移动和低速移动而变化。另外，若角色是人类的话，妖率计的范围会限制在-100%~+20%；而若是妖怪的话，则限制在-20%~+100%。因此人类侧没有妖怪侧的逢魔之时，妖怪侧也没有人类侧的逢魔之时。但当中的角色魂魄妖梦的设定比较特别，为-50%~+50%。

在关卡中，不少敌机和头目都会放出使魔进行攻击。敌人的使魔会在自机操作人类还是妖怪时产生变化，另外当在它们残存时击破本体，会变成不少的刻符被自机吸收。

人间操术时

人类侧时能够确认使魔的姿态，亦能以射击将之击坠。此外，当击破使魔时也会令本体受到一定伤害，但坏处是会使妖率计趋向0%。还有，当接触这些使魔时，则会发生被弹的情况。

妖怪操术时

妖怪侧时无法确认使魔的姿态，变为以不同颜色显示的魔法阵。此外，由于射击无法击中它们，所以无法将之击坠。不过在此状态下，即使接触有击中判定的使魔也不会视为被弹。当使魔与自机位置重叠时，其将不会发射弹幕，可以利用这点作为安全地带。

使魔的颜色

蓝：无击中判定

红：有击中判定

绿：无击中判定，射出的弹幕会根据自机是人类侧或妖怪侧而作出变化

黄：有击中判定，射出的弹幕会根据自机是人类侧或妖怪侧而作出变化

刻符：如前述一样

小型点道具：取得时的得分为点道具的十分之一，会在自机Power全满时代替P道具出现。

本作搭载了名为“终符”（Last Spell）的系统。官方网页表示是为了让头目也能“使用被弹Bomb”而生的。终符有分自机和敌人所使用的，在系统上这两种终符都是不同的东西。

敌机使用的终符

当在Normal或以上难度时，在关卡中取得达至指定值或以上的刻符，并且击败头目时，头目会在此时复活并使出终符。设定为头目“认真”的攻击，难度比普通的符卡更高。与其他符卡一样，在没有Miss下击坠头目即能将终符取得。

发动时对自机的限制

终符发动中，自机不能使用Bomb。在终符发动时自机被击中的话，会强制发动名为“符卡取消”（ディゾルブスペル）的符卡结束战斗，在不使自机的残机减少的情况下，进入下一关。

最终符及Extra中的终符

故事模式最后一关，头目必定会发动终符，全部难度也是，没有刻符指定值的限制。在Extra模式也是一样，但此处另有特别的条件，并且此条件也与一般引发终符的条件不同，为在前面的战斗中（包括道中）收集到七张或以上的符卡。

自机使用的终符

自机使用的终符是被弹Bomb的强化版本。体验版Plus时会在被弹时自动发动，而随后的版本则废止了自动发动的系统，改为由决死结界的张开来代替。

介绍

本作中在被弹后，自机的周围会展开“决死结界（Border of Life）”持续一段短时间。在展开决死结界时按下Bomb键的话即会使出终符作更强力的Bomb攻击。与前作的被弹Bomb一样都能避免Miss的发生，但需消费2个Bomb，不过剩下1个Bomb时仍能发动。此外当发动时若是人类侧的话，会自动切换成妖怪侧的角色，或是妖怪侧时，自动切换成人类侧的角色，使出该角色的符卡攻击（角色单独使用的话则不会切换）。

决死结界的张开时间

结界持续的时间，与Bomb的残数以及刻符的取得数成比例延缓。结界组有额外的时间加成。（另外，在敌人使用SpellCard的时候发动的决死结界，在一定时间内会将时间完全停止，画面也会变成醒目的红色。）还有，要注意在结界展开的过程中会逐渐消费刻符。

永夜抄六面有两条路线——A路线和B路线。六面A路线到达的最终BOSS是八意永琳，六面B路线到达的最终BOSS是蓬莱山辉夜。初次游戏会强制玩家进入6A路线，一周目不续关通关后开启一周目通关组合的6B路线。

六面路线选择方式：五面击破铃仙后进行选择。

而在四面也分A、B两条路线——四面A路线BOSS是博丽灵梦，四面B路线BOSS是雾雨魔理沙。

此路线通过选择机体时决定，如下：

1.若玩家选择的是咏唱组（雾雨魔理沙&爱丽丝·玛格特罗依德）或红魔组（十六夜咲夜&蕾米莉亚·斯卡雷特），则会开启4A路线；

2.若玩家选择的是结界组（博丽灵梦&八云紫）或幽冥组（魂魄妖梦&西行寺幽幽子），则会开启4B路线。

——游戏自带设定文档

（续表）

注1：使用次序编号解释：

使用次序编号写作X-Y：X为关卡编号，Y为符卡次序编号。若为道中符则在Y前面加一个C（即X-CY）

注2：难度简写为E(EASY)、N(NORMAL)、H(HARD)、L(LUNATIC)